मुख्य आयुक्त मुंबई सीमा शुल्क क्षेत्र III के प्रमुख हैं, जिनके पास CSMI हवाई अड्डे, एयर कार्गो कॉम्प्लेक्स, कीमती कार्गो सीमा शुल्क निकासी केंद्र (PCCCC), हवाई अड्डा छँटाई कार्यालय (APSO) और कूरियर सेल, निवारक आयुक्तालय और आयुक्त के सीमा शुल्क कार्य पर अधिकार क्षेत्र है। अपील करना)। मुख्य आयुक्त (सीसी) पूरे मुंबई सीमा शुल्क क्षेत्र III पर प्रशासनिक नियंत्रण और पर्यवेक्षण का प्रयोग करते हैं। मुख्य आयुक्त प्रशासनिक, तकनीकी और सतर्कता मामलों पर केंद्र सरकार द्वारा समय-समय पर जारी निर्देशों/दिशानिर्देशों सहित सीमा शुल्क कानूनों और सीमा नियंत्रण विनियमों के उचित कार्यान्वयन की निगरानी करता है। मुख्य आयुक्त सीमा शुल्क क़ानून के तहत उसे दिए गए कुछ वैधानिक कार्यों का भी निर्वहन करता है। मुख्य आयुक्त एक समिति का सदस्य होता है जो आयुक्तों द्वारा जोन में उनकी वैधता और औचित्य के लिए पारित न्यायिक आदेशों की समीक्षा करता है। मुख्य आयुक्त मुंबई जोन-III के आयुक्त सीमा शुल्क (अपील) के कामकाज की निगरानी भी करते हैं। मुख्य आयुक्त सीधे केन्द्रीय उत्पाद एवं सीमा शुल्क बोर्ड, वित्त मंत्रालय, नई दिल्ली को रिपोर्ट करते हैं।

 

मुख्य आयुक्त के कार्यालय में एक अतिरिक्त आयुक्त, एक उप/सहायक आयुक्त और सहायक कर्मचारी होते हैं। वे राजस्व संग्रह की निगरानी, ​​व्यापार सुविधा उपायों के निर्माण, निवारक और तस्करी विरोधी जांच, बकाया की वसूली, पेंडेंसी के निपटान, शिकायतों के निवारण और व्यापार/जनता की शिकायतों के निवारण में सहायता करते हैं। अंचल के भीतर आयुक्तालयों के बीच समन्वय और आयात और निर्यात कार्यों को सुविधाजनक बनाने के लिए व्यापार के साथ प्रभावी बातचीत भी मुख्य आयुक्त कार्यालय द्वारा नियंत्रित की जाती है। यह केंद्रीय अप्रत्यक्ष कर और सीमा शुल्क बोर्ड को राजस्व संग्रह में प्रगति और समय-समय पर बयानों और रिपोर्टों के माध्यम से अंचल द्वारा प्राप्त अन्य सीमा शुल्क संबंधी कार्यों के बारे में बताता रहता है। यह राजस्व अनुमान बनाने के लिए आयात और निर्यात की प्रवृत्ति का भी विश्लेषण करता है और ठहराव समय को कम करने के लिए व्यापार सुविधा उपायों की योजना बनाता है।